No esta claro del todo el origen de la bandera, porque existe otra versión: Los historiadores de la República Peruana, (Leguía y Martínez, Pareja Paz Soldán), tienen una explicación diferente: La bandera peruana tendría los colores rojo y blanco debido a que José de San Martín tomó el rojo de la bandera chilena y blanco, de la bandera argentina en reconocimiento al hecho que el  Ejército Libertador estaba conformado por soldados de estas dos naciones.

Luego de cinco meses de ser instituida la primera bandera nacional, ya en marzo de 1822, José Bernardo de Tagle, marqués de Torre Tagle y Supremo Delegado de la República, quien reemplazara internamente a José de San Martín, cuando éste realizó un viaje a Guayaquil, decretó un nuevo diseño de la bandera. La composición establecía una franja blanca transversal encarnada entre dos de color rojo de la misma anchura con un Sol en el centro. Esta modificación se efectúa en respuesta a los inconvenientes que generaban la confección de la anterior bandera. Pero en los campos de batalla se presento un inconveniente: El parecido con la bandera de España hacia difícil la diferenciación de los ejércitos, lo que motivo un nuevo cambio de la bandera.